By this author

The 3VmrMLM Method Provides New Genomic Variants Associated with Fiber Characteristics in Flax

Issue number 1 from 01.01.2025

Лен – важная сельскохозяйственная культура, выращиваемая для получения масла или волокна. Льняное волокно используется в различных областях промышленности, и выведение новых сортов льна-долгунца с лучшими характеристиками волокна представляет интерес. Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS) позволяет найти варианты, ассоциированные с характеристиками, важными для качества волокна, однако различия в данных, связанные с разными погодными условиями при выращивании в разные годы, понижают мощность методов GWAS. Метод 3VmrMLM допускает поиск вариантов для данных, измеренных в нескольких средах, позволяя найти новые варианты, не найденные другими методами. В качестве разных сред были взяты измерения в разные годы, и метод позволил найти всего 205 вариантов, характерных для всех или нескольких сред, 37 из которых попадали в тело известных генов с важными функциями. Наличие эффекта некоторых вариантов на характеристики волокна былo также подтвержденo на независимой выборке растений.

27 0

Effect of Vernalization on the Expression of Flowering Time Genes in Chickpea

Issue number 2 from 01.02.2025

Яровизация, или длительное воздействие холода, существенно ускоряет зацветание и увеличивает урожаи многих культур. Механизмы влияния яровизации на переход к цветению хорошо изучены у модельного организма Arabidopsis thaliana, однако до сих пор не раскрыты у бобовых. Мы рассмотрели действие яровизации на экспрессию генов цветения у одной из важнейших зернобобовых культур – нута. Ответ на яровизацию свойственен для диких видов нута, а у культурных сортов это свойство во многом утрачено. Сравнение экспрессии ортологов основных регуляторов цветения Arabidopsis у дикого и культурного нута показало, что относительные уровни концентраций продуктов генов FTa1 и FTa3 существенно повышались после яровизации независимо от вида. В то же время, ответ на яровизацию генов, активируемых FT, различался между культурным и диким нутом, предполагая отличия механизмов регуляции в генной сети.

37 0