By this author

A Deep Learning Approach to Predict Histone Variant Effects on Nucleosome Stability

Issue number 6 from 15.10.2025

Гистоны играют ключевую роль в организации хроматина и регуляции генов, модулируя стабильность нуклеосом и доступность ДНК. Различные варианты гистонов могут изменять плотность упаковки ДНК и влиять на функции клетки. В данном исследовании продемонстрировано успешное применение разработанной нейронной сети ProBAN для прогнозирования аффинности белок-белковых взаимодействий, что может применяться для оценки влияния различных вариантов гистонов на стабильность нуклеосом. Показано, что включение вариантов гистонов в нуклеосому может стабилизировать или дестабилизировать структуру октамера гистонов посредством измененных паттернов межмолекулярных взаимодействий. В частности, замещающие варианты гистонов H2A.Z, TSH2A.1-TSH2B.1 (в форме димера) и H3.3 образуют более стабильные структуры внутри нуклеосомы, чем канонические гистоны, в то время как другие варианты, такие как TSH2A.1, TSH2B.1 (по отдельности) и H3.6, продемонстрировали менее стабильные взаимодействия. Наблюдаемые различия могут объяснять, как клетки регулируют гены в специализированных тканях или в процессе развития. Эти результаты демонстрируют, какое действие вариации последовательностей гистонов оказывают на стабильность нуклеосом, что важно для регуляции транскрипции и эпигенетических механизмов. Алгоритм ProBAN продемонстрировал высокую точность предсказаний, представляя собой ценный инструмент для дальнейшего изучения влияния вариантов гистонов на функционирование хроматина и развитие заболеваний.

35 0