Статьи автора

Молекулярно-динамическое моделирование фармакологических пар «вектор–рецептор» для специфической доставки лекарств в опухоль: атомно-молекулярные механизмы встраивания RGD-пептида в рецепторе αβ-интегрина

Номер выпуска 3 от 12.03.2025

Проведены компьютерные молекулярно-динамические исследования процессов взаимодействия фармакологической пары «вектор–рецептор» для моделирования перспективных механизмов и процессов специфической доставки лекарств в опухоль. Целью вычислительных расчетов являются процессы взаимодействия и определение пространственных положений системы «RGD-пептид + рецептор αβ-интегрина», сольватированного водой. Из молекулярно-динамического моделирования получены конфигурационные положения системы «RGD-пептид + αβ-интегрин» в 100 нерелаксированных состояний. При этом были смоделированы два RGD-пептида, находящиеся вне и внутри рецептора αβ-интегрина. Один из них представляет собой пептид исходного файла PDB, локализованный внутри рецептора αβ-интегрина. Другой RGD-пептид в исходном положении находится вне рецептора, свободно диффундирует по всей области ячейки моделирования и естественным образом вступает в контакт и связывается с αβ-интегрином.

35 0